お問い合わせいただいておりました「サイト認証に失敗する件」ですが、現在の状況はいかがでしょうか。

こちらで調査・修正を行い、現在は状況が改善しておりますので、いま一度サイト認証をお試しくださいますようお願い申し上げます。
なお、サイト認証をお試しいただいても、失敗が継続する場合はお手数をおかけいたしますが、再度ご連絡ください。

このたびは弊社のサービスに関しまして、繰り返しご連絡をいただき、お手数をおかけいたしましたこと、重ねてお詫び申し上げます。
今後も、Yahoo!検索をより快適にお使いいただけるよう、サービスの改善を図ってまいります。また何かお困りの点やお気づきの点がございましたら、
ぜひお知らせいただけますと幸いです。

これからもYahoo! JAPANをよろしくお願いいたします。

サイト認証（認証済み）

になってた。まだYahoo!からの回答メールは来ていない。
ちなみに認証日時は、2010/01/10（UTC）。
なんかしっくりこないが、とりあえず回答メールを確認してこの件はクローズかな。

このたびは、ご不便とご迷惑をおかけしておりますことを、深くお詫び申し上げます。
お客様よりご指摘いただきました事象につきましては、現在こちらで調査を行っております。
速やかな対応を心がけ、日々努力いたしておりますが、お問い合わせの内容や調査時間により、回答までにお時間をいただく場合がございます。

お客様におかれましてはご不便をおかけし誠に申し訳ございませんが、何卒ご理解くださいますようお願い申し上げます。
これからもYahoo! JAPANをよろしくお願いいたします。

お問い合わせくださいました「サイト認証の失敗」についてご案内いたします。

誠に恐れ入りますが、サイト認証が失敗する場合、サイト認証ページに
表示されている認証失敗の理由と対処方法をご参照のうえ、お客様ご自身でご対応くださいますようお願い申し上げます。

お手数ですが、以下のヘルプページもあわせてご参照いただけますと幸いです。

◇サイト認証に失敗するときは

http://help.yahoo.co.jp/help/jp/siteexplorer/siteexplorer-25.html

また、恐れ入りますが、サイト認証を行う際は「HTML認証」または「メタタグ認証」のいずれかの方法でお試しいただけますでしょうか。

※「メタタグ認証」を行う際には、HTML認証をお試しいただいた際にアップロードした認証ファイルを削除してください。同様に「HTML認証」を行う際には、メタタグ認証をお試しいただいた際に記載したメタタグを削除してください。
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■メタタグ認証をご利用の場合

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お手数ですが、メタタグを＜head＞内の最初に貼り付けているか、認証キーが一致しているかを再度ご確認くださいますようお願いいたします。

発行されたメタタグは、＜head＞タグの最初に設置していただく必要がございます。メタタグを挿入した位置をご確認ください。

認証キーは、1つのサイトで1管理者に対し、1つの認証キーが付与されます。
複数の管理者で管理されている場合や、複数のサイトを管理されている場合は、記載した認証キーが認証画面の認証キーと一致しているか、いま一度ご確認をお願いいたします。

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なお、サイト認証は、認証開始から通常24時間以内に完了いたしますが、サイトによっては、24時間以内に承認されない場合もございます。
お困りのところ、お手数をおかけして大変申し訳ございませんが、数日時間をおいてから、いま一度認証をお試しください。

再度認証をお試しいただいても失敗が続く場合には、より的確な回答を差し上げたいと存じますので、お手数ですが、下記の情報につきまして詳細をお知らせいただけますと幸いです。

＜すでにお知らせいただいた情報＞
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・認証失敗した際のエラーコード番号：【3-1501】、【9-999】
・認証失敗となった画面の日本語のエラー全文：
*robots.txtによって認証キーへのアクセスが拒否されました。robots.txtの内容を確認してください。【3-1501】
* 認証キーにアクセスできませんでした。【9-999】
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＜再度お知らせいただきたい情報＞
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・管理サイトに追加したサイトのURL：
・HTML認証かメタタグ認証か：
・認証を行った正確な日時：
・HTML認証での、HTML認証ファイルの設置URL：
（※URLは省略せず、全文をお書き添えくださいますようお願いいたします。）
・メタタグ認証の場合は、メタタグを記述したページURL：
・その他お気づきの点：
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このたびは確認事項が多く、大変お手数をおかけいたしますが、何卒ご協力くださいますようお願いいたします。
これからもYahoo! JAPANをよろしくお願いいたします。

とりあえず、追加で求められた情報をメール返送。今日の解決は無理だった。
いずれにせよ、robots.txtをサーバから削除しても、robots.txtからみのエラーが表示されるのは何らかの問題があるように見える。
ネット検索しても同様の事象は見つからない。そして昨日リンクさせて頂いたYahoo!知恵袋の質問はもうアクセスできなくなっている。自分の環境が原因なのだろうか、スッキリしないな・・・

• robots.txtによって認証キーへのアクセスが拒否されました。robots.txtの内容を確認してください。【3-1501】
• 認証キーにアクセスできませんでした。【9-999】

ちなみに状況は以下のとおり。

• ホスティングは「さくらインターネット さくらのレンタルサーバ スタンダード」を利用
• robots.txtも特に認証ファイルを弾くような指定はしていない
• ドメインを登録して、「サイト認証」からHTML認証とメタタグ認証どちらも試したがダメ。
• google の同様のサービス「ウェブマスターツール」では問題なく認証完了

結局、Yahoo!へ問い合わせしたので結果待ち。